| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 64.962182% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 16.150038 M |
| total bases: | 1.954155 G |
| Q20 bases: | 1.933544 G (98.945272%) |
| Q30 bases: | 1.863145 G (95.342767%) |
| GC content: | 61.256167% |
| total reads: | 16.090934 M |
| total bases: | 1.615327 G |
| Q20 bases: | 1.600662 G (99.092167%) |
| Q30 bases: | 1.544654 G (95.624887%) |
| GC content: | 61.489802% |
| reads passed filters: | 16.090934 M (99.634032%) |
| reads with low quality: | 24.018000 K (0.148718%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 35.086000 K (0.217250%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 62883 |
| AGATCG | 49025 |
| AGATCGG | 44128 |
| AGATCGGA | 37450 |
| AGATCGGAA | 34995 |
| AGATCGGAAG | 32269 |
| AGATCGGAAGA | 30161 |
| AGATCGGAAGAG | 29142 |
| AGATCGGAAGAGC | 26507 |
| AGATCGGAAGAGCA | 24728 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 22271 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 20732 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 18033 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 17167 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 15626 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 14158 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 13345 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 11590 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 10399 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 9475 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 8636 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 7980 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 7424 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 23398 |
| other adapter sequences | 102711 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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