| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 64.632434% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 13.332334 M |
| total bases: | 1.613212 G |
| Q20 bases: | 1.596780 G (98.981375%) |
| Q30 bases: | 1.539912 G (95.456246%) |
| GC content: | 61.102025% |
| total reads: | 13.290298 M |
| total bases: | 1.334604 G |
| Q20 bases: | 1.322796 G (99.115253%) |
| Q30 bases: | 1.277353 G (95.710308%) |
| GC content: | 61.319003% |
| reads passed filters: | 13.290298 M (99.684706%) |
| reads with low quality: | 17.690000 K (0.132685%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 24.346000 K (0.182609%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 47858 |
| AGATCG | 36929 |
| AGATCGG | 32843 |
| AGATCGGA | 27529 |
| AGATCGGAA | 26202 |
| AGATCGGAAG | 24327 |
| AGATCGGAAGA | 22879 |
| AGATCGGAAGAG | 22094 |
| AGATCGGAAGAGC | 20278 |
| AGATCGGAAGAGCA | 18515 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 17051 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 15720 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 13615 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 13303 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 12191 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 10829 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 10069 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 8863 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 8086 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 7281 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 6738 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 6031 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 5572 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 13112 |
| other adapter sequences | 85250 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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