| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 60.642229% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 10.923271 M |
| total bases: | 1.321716 G |
| Q20 bases: | 1.308416 G (98.993742%) |
| Q30 bases: | 1.261651 G (95.455563%) |
| GC content: | 61.001523% |
| total reads: | 10.884641 M |
| total bases: | 1.092694 G |
| Q20 bases: | 1.083062 G (99.118553%) |
| Q30 bases: | 1.045603 G (95.690412%) |
| GC content: | 61.215382% |
| reads passed filters: | 10.884641 M (99.646351%) |
| reads with low quality: | 13.555000 K (0.124093%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 25.075000 K (0.229556%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 42115 |
| AGATCG | 33378 |
| AGATCGG | 29870 |
| AGATCGGA | 25820 |
| AGATCGGAA | 23728 |
| AGATCGGAAG | 22058 |
| AGATCGGAAGA | 20479 |
| AGATCGGAAGAG | 19711 |
| AGATCGGAAGAGC | 17904 |
| AGATCGGAAGAGCA | 16751 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 15094 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 13991 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 12479 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 11493 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 10576 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 9909 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 8816 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 7819 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 7022 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 6493 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 5961 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 5298 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 4875 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 18599 |
| other adapter sequences | 68812 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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