| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 99bp |
| duplication rate: | 62.952247% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 15.677963 M |
| total bases: | 1.897034 G |
| Q20 bases: | 1.876603 G (98.923021%) |
| Q30 bases: | 1.807615 G (95.286422%) |
| GC content: | 60.942668% |
| total reads: | 15.582736 M |
| total bases: | 1.557636 G |
| Q20 bases: | 1.543670 G (99.103422%) |
| Q30 bases: | 1.489862 G (95.648950%) |
| GC content: | 61.182406% |
| reads passed filters: | 15.582736 M (99.392606%) |
| reads with low quality: | 25.142000 K (0.160365%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 70.085000 K (0.447029%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 74154 |
| AGATCG | 60817 |
| AGATCGG | 55523 |
| AGATCGGA | 48856 |
| AGATCGGAA | 46576 |
| AGATCGGAAG | 43232 |
| AGATCGGAAGA | 40740 |
| AGATCGGAAGAG | 40787 |
| AGATCGGAAGAGC | 37275 |
| AGATCGGAAGAGCA | 34497 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 32049 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 29324 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 26862 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 25142 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 23819 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 21520 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 20105 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 18553 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 17049 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 15721 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 14693 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 13169 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 12291 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 11253 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCA | 10266 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 50558 |
| other adapter sequences | 172840 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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